当初は伊勢崎線区に配属され、
半蔵門線直通に使用されていましたが、
半蔵門線直通列車が一部を除き５００５０系化され、
２００６年ごろに地上用に転換された後、
２０１１年に東上線に転属しました。
３１６０１編成はアルナ工機、３１４０１編成は東急車輛で製造され、
半蔵門線直通列車使用時は基本的にペアで使用されていましたが、
地上用転換の際は別々に使用(運用の都合上ペアで使用されたこともたまにあった模様)し、
さらに東上線転属時には運転台計器類がグラスコクピット化され、
３６６０１号車と３１４０１号車の運転台を撤去して再びペアで使用されています。
なお、他線転属も視野に入れてか、
運転台等の撤去のみで運転室は残されています。
